Individualiserte blodprøver kan overvåke tumornivåer etter terapi og bestemme tilbakefall av kreft


Individualiserte blodprøver kan overvåke tumornivåer etter terapi og bestemme tilbakefall av kreft

Data fra hele genomsekvensen av kreftpasienter har blitt brukt til å utvikle individualiserte blodprøver som trolig vil hjelpe leger til å skreddersy pasientens behandlinger, sier forskere ved Johns Hopkins Kimmel Cancer Center. Disse nye genom-baserte blodprøver kan brukes til å overvåke svulstnivåer etter behandling og avgjøre om kreft kommer tilbake (tilbakefall).

Victor Velculescu, MD, Ph.D., lektor i onkologi og meddirektør for kreftbiologiprogrammet hos Johns Hopkins, sa: "Vi tror at dette er den første applikasjonen av nyere generasjoner av genomsekvenser som kan være klinisk nyttig for Kreftpasienter. Ved hjelp av denne tilnærmingen kan vi utvikle biomarkører for potensielt enhver kreftpasient."

Ifølge en artikkel publisert i Science Translational Medicine , 24. februar utgav forskerne pasienternes genomer for endringer som de sier, de fleste forskere har ikke latt etter omplasseringer av store biter av DNA i stedet for endringer i et enkelt DNA-brev blant milliarder andre. De kaller deres nye tilnærming Personlig analyse av omarrangerte slutter (PARE).

Bert Vogelstein, MD, Clayton professor i onkologi, meddirektør for Ludwig-instituttet på Johns Hopkins, og undersøker i Howard Hughes Medical Institute, sa: "I sekvensering av individer-genene har vi fokusert på endringer i en bokstav, men I denne studien så vi etter bytte av hele seksjoner av tumorgenomet. Disse endringene, som omregning av kapitler i en bok, er lettere å identifisere og oppdage i blodet enn endringer i en bokstav."

Disse typer DNA-omarrangementer er kjent for å forekomme bare i kreftceller og ikke i ikke-kreftige, noe som gjør dem til perfekte biomarkører for kreft.

Ved bruk av seks sett med kreft- og normale vevsprøver tatt fra fire kolorektale og to brystkreftpatienter brukte laget neste generasjons sekvenseringsmetoder til å katalogisere genomets sekvensdata for hver enkelt pasient. For å finne DNA-omarrangementer, identifiserte laget først regioner hvor antall DNA-kopier var mer eller mindre enn forventet, og hvor deler av forskjellige kromosomer fusjonerte sammen. Disse områdene ble ytterligere analysert for å identifisere DNA-sekvenser som viser feil ordre, orientering eller avstand. Et utvalg av fire til 15 omarrangementer ble funnet i hver av de seks prøvene.

De identifiserte først DNA-omarrangementer i pasientens svulsteksample, og så etter samme endringer i DNA-skjul fra svulster i pasientens blod. De amplifiserte DNA som ble funnet i blodprøver av to kolorektale kreftpasienter og fastslått at disse testene var følsomme nok til å detektere omarrangert tumor-DNA i disse prøvene.

Vitenskapsmennene sier at resultatene fra slike blodprøver kan hjelpe leger med å oppdage kreft eller dets gjentakelse og informere dem om hvordan en pasient reagerer på kreftbehandling. I en kolonkreft pasientens eksempel fant forskerne en del av kromosom fire fusjonert til en del av kromosom åtte.

Rebecca Leary, en kandidatstudent ved Johns Hopkins Kimmel Cancer Center, sa: "Vi utviklet en biomarkør som kunne spenne denne omarrangementet og brukte en blodprøve for å evaluere biomerkernivåene ettersom pasienten mottok en rekke kreftbehandlinger."

Etter førstegangsoperasjon falt biomarkørnivået hos pasienter fordi hovedparten av svulsten ble fjernet. Biomarkørene steg igjen, noe som indikerer at ytterligere kreft forblir i pasientens kropp. Etter kjemoterapi og en annen operasjon, falt nivåene av biomarkøren betydelig, men viste fortsatt et lite, men målbart nivå av biomarkøren. Dette var i samsvar med en liten metastatisk lesjon som forblev i pasientens lever.

Etterforskerne mener at PARE-baserte biomarkører også kan brukes til å bestemme om kreftceller er tilstede i kirurgiske marginer eller lymfeknudevev fjernet under operasjonen og muligens for å diagnostisere tidlig sykdom.

Luis Diaz, professor i onkologi ved Johns Hopkins, sa: "Til slutt tror vi at denne typen tilnærming kan brukes til å oppdage tilbakefallende kreft før de blir funnet ved konvensjonelle bildemetoder, som CT-skanninger."

Velculescu forutsier at teknologien som brukes til å undersøke pasientens genomene, blir billig. Han sier at genomsøkningen koster dem ca $ 5000 per pasient, men at sekvenseringskostnadene fortsetter å falle. CT-skanninger koster for tiden $ 1500 per skanning og er begrenset i deres evne til å oppdage mikroskopiske kreftformer.

Kenneth W. Kinzler, Ph.D., professor i onkologi og meddirektør i Ludwig-senteret på Johns Hopkins, sa: "Hvis dagens trender i genom-sekvensering fortsetter, vil PARE være mer kostnadseffektiv enn CT-skanning og kunne vise seg å være mer informativ."

Johns Hopkins-teamet, som har innlevert patenter på teknologien, sier at de planlegger å teste flere pasientprøver og forfine sine teknikker slik at en kommersielt gjennomførbar genom-basert blodprøve kan oppnås.

Under en lisensavtale mellom Johns Hopkins University og Genzyme, Velculescu, Vogelstein og Kinzler, har du rett til en andel av royalties mottatt av universitetet ved salg av produkter relatert til forskning beskrevet i dette dokumentet. Vilkårene for disse ordningene styres av Johns Hopkins University i samsvar med politikkets interessekonflikt.

National Institutes of Health, Lustgarten Foundation, National Colorectal Cancer Research Alliance, og en UNCF-Merck fellesskap finansierte forskningen.

Andre deltakere i forskningen inkluderer Isaac Kinde, Frank Diehl og Kerstin Schmidt, fra Johns Hopkins; Chris Clouser, Cisilya Duncan, Alena Antipova, Clarence Lee, Kevin McKernan og Francisco De La Vega fra Life Technologies.

Kilde: Johns Hopkins Medicine

162nd Knowledge Seekers Workshop 2017 03 09. Subtitles. (Video Medisinsk Og Faglig 2022).

§ Problemer På Medisin: Sykdom